Maconomy komt voort uit PPU Software A/S, opgericht in1983 door Per Tejs Knudsen, Philip Dam, en Ulrik Jørring.
In 1984-1989 de drie entrepeneurs ontwikkelden gepassioneerd de technologie welke het uitgangspunt werd voor verdere groei. PPU Software A/S ontwikkelde en verkocht een bedrijfsapplicatie voor de Hewlett-Packard HP3000 mini computer. In 1989 werden alle activiteiten samengevoegd in de onderneming PPU Maconomy A/S, geleidt door Per Tejs Knudsen als CEO.
Gedurende de jaren 1990 ontwikkelde het bedrijf ondersteuning voor het internet zonder haar product architectuur te herontwikkelen. In 1998 lanceerde Maconomy haar eerste op web-based oplossingen, inclusief een web shop en een Java-based urenstaten client.
In het licht van de voortdurende sterke groei in Maconomy's marktsegment, besloot de onderneming tot een beursgang in het 4e kwartaal van 2000. Ondanks turbulentie op de internationale aandelenbeurzen, was de onderneming in staat om de IPO met succes af te ronden, waarmee de basis gelegd werd voor toekomstige groei van de onderneming.
In juni 2002 werd Bent Larsen, destijds al 10 jaar voorzitter van de RvC, de CEO. De groeistrategie werd geformuleerd en geplubiceerd. Centraal in deze strategie was een verhoogde focus op segmenten die Maconomy in staat stelt te profiteren van meer dan 15 jaar ervaring in deze branches.
In Juni 2005 werd Hugo Dorph aangesteld als nieuwe CEO van Maconomy. Zijn voornaamste doelstelling was een nieuw tijdperk van groei te realiseren. Na een significante groei gedurende 2006 tot 2008, kondigde Hugo Dorph en het Management team een drie- jaren groeiplan aan dat Maconomy moet leiden naar Europees leiderschap in ERP oplossingen voor professionele dienstverleners in 2011.